Machinarium – tai keista vieta, kurioje karaliauja tik robotai. Pagrindinis veikėjas -irgi robotas – buvo išmestas į savartyną. Grįžęs iš ten į savo miestą supranta, jog kai kas nori jį sunaikinti. Reikės rasti kelią, kaip to sunaikinimo išvengti.