Link’as sugrįžta naujame žaidime! Burtininkė Vaati paverčia Princesę Zeldą akmeniu, todėl Karalius Hyrule skiria Link’ui užduotį, kurios metu jam teks pabuvoti vietose kurių jis net negalėjo įsivaizduoti. Naudodamasis stebuklingos kepurės, vadinamos Minish Cap, galiomis Link’as pasiners į nesibaigiančius nuotykius!