26 amžius, žmonija paplito po visą visatą, tačiau paprasti žmonės valdo tik nedidelę jos dalį. Tikrieji valdovai yra cyborgai Tyi ir biogenetiškai tobuli Genidai. Tačiau jų nesutarimai į kovą įtraukė senovinę ateivių rūšį, kuri prasidėjo karą dėl visos visatos dominavimo, todėl žaidimas suksis būtent apie šį įvykį.

Na, o be įdomios istorijos, Black Prophecy gali pasigirti masinėmis realaus laiko kovomis, įvairiomis misijomis, bei galimybėmis modifikuoti ir nuolat tobulinti valdomą erdvėlaivį. Bėda tik tame, kad žaidimo pasirodymo dieną negalėsime išlipti iš savo erdvėlaivio, bet šią galimybę planuojama įdiegti su naujausiu atnaujinimu.